Alexander Vergara

Finalmente me animé a ordenar los links y tutoriales que tengo de R y PERL

fotos de mi abuelita estudiando del “Libro de la llama” y del libro BIOCONDUCTOR, con paquetes para biología de R

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O’ REILLY OPEN BOOKS

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O’ Reilly puso algunos libros gratis acá: http://www.oreilly.com/openbook/

Aprovecho el impulso y les dejo con algo más que les puede ser útil:

RESUMENES DE COMANDOS DE Perl y R :

perlrefcard.pdf

refcard.pdf

Además, tengo algunos pdfs de manuales de Perl que si quieren puedo enviarles por email
(The Perl Cookbook O’Reilly y la “Referencia Compelta Perl” McGraw Hill entre otros)

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Cómo buscar un patrón en un file desde la linea de comandos ?

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#con Perl ,

perl -ne 'if( /patron/ ){ print }' inputfile

# Imprimirá las filas con ese patrón

despues lo tiramos a un file por la cañeria si queremos

perl -ne ‘if( /patron/ ){ print }’ inputfile > outputfile

listo

Obviamente con grep ‘patrón’ hubiera sido mas corto dirán ustedes, pero veamos como se vería en un split de Perl.

Cortemos por comas un file de dos columnas e imprimamos estas “hacia abajo” . Luego con un sort uniq y a un grep -v, que nos eliminará aquellas filas con un name que no queramos imprimir (Bush).

paz amor

familia alegría

auto feo

feo Bush

perl -ne ’split(/,/); print $_[0],”\n”,$_[1],”\n”‘ inputfile | sort | uniq | grep -v bush > outputfile

output file luce asi:

paz

amor

familia

alegria

auto

feo

#muy largo?

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USANDO DISTRIBUCION HIPERGEOMETRICA EN R

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Hola, este comentario lo pongo para dar un ejemplo de muestreo estadístico sin reemplazo usando R.

Piensen en una fiesta llena de mujeres. ( N feminas en total ).
Definamos 2 tipos de feminas: las “ricas” y las “No ricas”.

“mina rica” = expresión polular en CHILE para hacer referencia a mujeres guapas.

Hay “R” minas ricas y “1-R” minas No ricas.
supongamos que el numero de “minas ricas”= 5 y el de “No ricas” = 45 en esta fiesta (siempre hay menos ricas)
Haciendo un muestreo sin reemplazo de 10 minas minas del carrete al azar,¿Cuál es la probabilidad de que 4 de las 10 minas sean ricas? ¿Cómo calcular esto con R?
el código sería:
……………………………………………………….
choose (5,4) * choose (45,6) / choose (50,10)
……………………………………………………….
Hazlo!! te dará una probabilidad baja como obviamente esperas, pero es un ejemplo ilustrativo de como hacerlo en R
el resultado….. 0.0039 jajajajjaja
un uso práctico de la distribución hipergeométrica